分子智藥以 HPE GPU 伺服器賦能引領 AI 新藥研發新浪潮

HPE分子製藥（左起）博鉅資訊陳勇聰總經理、生物技術開發中心劉韋博處長、分子智藥卓東昇共同創辦人、分子智藥劉昕共同創辦人兼技術長、HPE 慧與科技郭裕昇副總經理、HPE 慧與科技胡金雲副總經理

近年 AI 技術蓬勃發展，驅使全球 AI 在藥物開發的應用快速進展。財團法人生物技術開發中心（DCB）劉韋博處長表示，AI 藥物開發公司從 2021 年的 300 家激增至 2024 年的 950 家，包含生醫大數據處理、早期藥物發現、藥物設計優化、藥物重新定位及臨床開發等跨域生態圈儼然成形，吸引全球製藥大廠競相投資合作。影響所及，綜觀 2024 年前十大 AI 藥物開發投資合作案，授權金額經常超過 10 億美元，甚至不乏突破 20 億美元之例。

隨著 AI狂潮席捲全球，新藥研發也站上科技前沿。創立於2019年的分子智藥，來自臺灣大學計算化學實驗室，結合資訊、藥化與生科人才，以AI為研發引擎，致力改寫新藥開發緩慢且高風險的宿命。其初期專注於藥物吸收、分布、代謝、排泄與毒性（ADMET）的早期評估預測，後續隨技術精進再挺進藥物動力學（PK）建模，拓展至先導化合物的優化與合成分析，涵蓋臨床前多項關鍵環節，展現跨域整合與深度應用實力。

為驗證AI研發成果，分子智藥與 DCB 攜手合作。劉韋博處長指出，臺灣 AI 藥物開發雖在起步階段，但從全球生醫供應鏈來看，臺灣無論在靶點探索分析、藥物精實篩選、設計優化開發、特性模型驗證及藥物重新定位等範疇，皆深具發展潛力。DCB 正建構 AI 藥物生態系，透過串聯 AI 公司、ICT 產業與實驗流程，加速創新分子從概念到實驗落地；分子智藥也藉由 DCB 早期專案數據與實驗支援，順利完成候選化合物的 AI 預測、合成與驗證，大幅提升研發效率。

隨著 AI 研發能量急遽擴張，分子智藥決定打造以 NVIDIA GPU 為核心的 AI 基礎設施。其不僅著重 GPU 本體，更重視最佳化機構設計、優異的硬體元件搭配、售前／中／後支援服務完整性。經審慎評估後，選定以 HPE DL380a Gen11 伺服器作為 AI 藥研的發展基石。

自建算力基礎，穩控成本與資料安全

AI 新藥開發過程，往往面臨資料稀缺的痛點。分子智藥技術長暨共同創辦人劉昕指出，實驗數據取得不易，樣本少且變異大，使 AI 模型訓練充滿挑戰；且即便 AI 能精準預測分子活性，若無法合成終將失去價值。分子智藥共同創辦人卓東昇分享，為突破限制，其團隊整合藥物化學知識與逆合成邏輯，開發創新演算法，能迅速篩選高潛力、無毒性的分子，並準確分析合成可行性，大幅降低試錯成本，顯著提升研發效率。

隨著演算法不斷進化，分子智藥將業務觸角從 ADMET 預測延伸至藥物改進，同時將研發範疇從小分子擴展到大分子，使原本仰賴的工作站搭載消費型顯卡所形成的算力結構捉襟見肘。其曾嘗試雲端 GPU 即服務（GPUaaS），卻發現在重度使用下不僅租賃費用高昂且資料安全難控。經評估，自建 GPU 伺服器僅需四個月就能回本，且更能確保資料自主性與彈性擴充能力，因此毅然投資自建算力平台。

HPE 成最佳後盾，實現「算力即戰力」

分子智藥慧眼獨具，最終選定搭載四張 NVIDIA L40S 顯示卡的 HPE DL380a Gen11 GPU 伺服器作為 AI運算核心。劉昕表示，L40S 在 FP32 單精度運算上效率甚高，加上 HPE 針對 CPU、記憶體、頻寬、儲存、散熱、擴展性的全面優化設計，使團隊能無後顧之憂專注模型開發。

HPE 標準運算系統暨數位銷售事業處副總經理郭裕昇強調，HPE 除供應硬體外，更扮演策略合作夥伴，透過完整服務生態協助分子智藥優化 AI 架構的運作與部署。

HPE 代理夥伴鉅晶國際扮演統籌橋樑角色，聯手經銷商博鉅資訊，負責從需求規劃、測試驗證、規格確認到備品支援等前期整合服務。而博鉅資訊則由總經理陳勇聰帶領專業團隊，提供從設備建置、機房與機櫃空間設計、配電與散熱規劃、噪音防制，到後續即時維修的一站式技術支援，完整體現 HPE 生態系的高效協同。

郭裕昇進一步說明， HPE、鉅晶、博鉅三方協作，確保分子智藥AI平台 7x24 順暢穩定運行。而作為世界級 ICT 解決方案領導品牌的 HPE，亦正積極搭建 AI 新生態系，期望協助臺灣眾多產業先進與新創公司將優質 AI方案輸出國際，有望成為分子智藥進軍全球舞台的重要助力。

建模效能倍增，專案節奏全面加速

部署 HPE GPU 平台後，分子智藥的專案效率明顯躍升。其善用四張 L40S 顯示卡有效破除運算資源瓶頸，支持多個專案同步展開，讓整體作業效率如虎添翼。以小分子預測為例，模型訓練時間從一天縮至兩小時，提升 6~10 倍；以往無法執行的大分子模擬，如今已可於兩小時內完成。

劉昕說，過去常因算力不足而拖慢專案進程，如今每位工程師都能隨時執行實驗，有效縮短模型迭代週期。卓東昇也認為，團隊現在更能專注於模型性能精進與應用價值驗證，不再需要遷就於有限資源而反覆優化運作流程，使研發節奏更靈活高效。

打造藥研平台服務，鏈結臺灣生技產業生態

展望今後，分子智藥規劃動態擴增運算資源，並規劃建構「AI＋算力」混合服務，盼能支援中小藥廠、使他們無需自建團隊也能導入 AI。劉昕強調，分子智藥期許能成為這些藥廠的 AI 延伸戰力，提供整合服務，幫助夥伴們輕鬆展開創新研發。

因應資料不足與 AI 應用轉化等挑戰，分子智藥將持續深化產學合作，並與 DCB 合作推動 AI 藥物開發生態系的升級進化。與此同時，DCB 將整合 AI 開發、ICT 技術與實驗室流程，致力成為臺灣生技業鏈結國際的關鍵樞紐，為產業注入源源不絕的創新動能。

HPE 慧與科技最佳夥伴：鉅晶國際 0277307669

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